自主神经系统（植物神经系统）功能障碍是多系统萎缩最重要也是最难解决的问题。自主神经系统维持生命的基本功能，包括心血管系统、呼吸系统、消化系统、泌尿生殖系统，这些系统的正常运行，是生命的基础，相当于中医的元气。
自主神经功能的障碍。会出现尿频、尿急的情况，病情加重后会出现小便失禁、尿潴留、吞咽困难、瞳孔大小不等、呼吸困难或呼吸暂停等。早期血压比较平稳，加重后会出现严重的低血压，导致无法直立行走，反复晕厥。斑纹和手凉也是自主神经功能障碍所致，男性最早出现的症状是勃起功能障碍，女性为尿失禁。
中药对多系统萎缩治疗的效果是不错的，很多患者也都是因为当地医生对这个病不了解，都没见过是什么病所以说我们这边才会这个样子，一直得不到很好的治疗。因为此病的发病率很低，很少有大夫研究治疗。
经长期治疗总结，温补祛萎汤本着“治痿独取阳明”的原则，从肝肾阴虚、精血不足、健脾益气为本，治则滋补肝肾，活血通络为则，节五脏六腑、营养神经细胞、促进脑组织功能正常运转。参以《丹溪心法》“痿之不足乃阴血不足也”，根据痿证病机与致病因素，严谨辨证与精当用药。
是根据多年治疗此类疾病基础上总结出来的，采用纯中药组方，结合现代医学诊断，辨证施治，对症一人一方，配伍经大量临床经验。
遵循中医理论“先天生后天，后天养先天”之理，肝、脾、肾并治。肝藏血，主疏泄，肾藏精，生髓，脑为髓海，是精髓聚会之处，正因为肾精化生脑髓，从而得到脑神之用。脾为后天之本化生输布气血对脑髓起濡养作用。